Bing Image Creator で生成: Summer season, Landscape, Green Mountains which have snow on the top, yellow flowers, Photo
の続きです。
今回は、R で階層的クラスタリングをしてみようと思います。
まずは、クラスタリングのためのマトリックスを作成します。
それぞれの変数を標準化します。
for loop で各変数を (変数 - 変数の最小値) / (変数の最大値 - 変数の最小値) で最大値が 1、最小値が 0 に変換しました。summary() 関数でマトリックスを処理してみると、どの変数の最小値が 0 、最大値が 1 になっていることがわかります。
dist() 関数で dist オブジェクトを作成します。
hclust() 関数で階層的クラスタリングを実行します。
plot() 関数で結果をグラフにします。
青森県と佐賀県、北海道と鹿児島県、山形県と奈良県が隣同士になっているなど、地理的な位置関係とは全然違うクラスターですね。
5のグループに分けてみます。
左の３つのグループは統合したいですね。
まず、cutree() 関数で５つのグループのラベルを作ります。
2, 3, 5 のグループを統合するといいですね。
3 と 5 を 2 にしてしまいます。
これを、元の mtx に統合します。
続いて、都道府県名も変数に戻し、label3をファクター型に変換します。
各変数同士の散布図を描いて、クラスタリングがうまくできているかどうかをみてみます。
けっこういい感じにわかれています。
他の変数同士の散布図もみてみます。
こちらもクラスタリングを反映していますね。
今回は以上です。
最初から読むには、
です。
